Имеется ли возможность при выписке счета покупателю понять, какой товар уже имеется на складе, а какой надо заказать?

Да, такая возможность имеется. В программе предусмотрен алгоритм автоматического резервирования товаров на складах, который резервирует товары в соответствии с наличием товаров на складах с учетом ранее оформленных заявок от других покупателей. Кроме того, при подборе товаров в документ показываются остатки свободного товара (с учетом ранее оформленных заявок покупателям).