Да, может. Список скидок хранится в справочнике Типы скидок и наценок, который может быть в любой момент дополнен пользователем. При этом возможно назначение скидок только на определенные товары. При назначении скидки могут быть определены дополнительные условия, сумма документа, при котором назначается скидка, время действия скидки, скидка по дисконтной карте и т.д. Менеджер может назначить скидки, наценки контрагенту предварительно или в момент оформления документа.